平台亮点:
无偏差覆盖广谱的蛋白质组覆盖度,助力发现全新蛋白质组信息。
高深度分析无需高丰度去除或组分分离,即可实现对蛋白质组的高深度分析。
自动化流程从样品到肽段的全自动化处理,解放双手,提高生产力。
规模化研究可完成大队列化的设计方案,加速推进蛋白质组研究的深度探索。
为更好地解析蛋白质组,Seer基于其具有独特理化特性的纳米磁珠专利技术,创新性地开发了ProteographTM全自动化蛋白质组分析平台。ProteographTM平台提供了全新的蛋白质组学研究“视角”,能够使研究者从群体(大队列)和时间跨度上观测蛋白质组的广度、深度和动态变化。ProteographTM平台以其快速、可规模化的工作流程,实现了对如血浆等复杂蛋白质组样品的高深度、无偏差分析。

ProteographTM产品套件:快速、无偏差、高深度的蛋白质组探索利器
ProteographTM套件包括SP100自动分析仪、5种纳米颗粒组合的耗材以及ProteographTM数据分析软件。ProteographTM套件可无缝集成到现有实验设备上,下游能与现有的大部分质谱仪(Orbitrap, TimsTOF Pro等)配合使用。ProteographTM套件将速度、效率、覆盖度和数据分析完美结合,以全新的方式推动蛋白质组学研究。
优化的ProteographTM一次可同时分析多达16个样本,平行添加的质控样本(Quality Controls)可确保实验结果的可靠性。ProteographTM套件配合质谱,可在短短数小时内实现对数千种蛋白质的精确鉴定与定量分析。ProteographTM解决方案的定量能力、准确度、和高重现性,可助力研究者从容应对不同规模的蛋白质组研究(图1)。

自动化工作流:让你无忧开展规模化研究
只需将耗材和样品装入SP100并按下“Start”按钮,即可启动自动化操作程序(图2)。SP100将每个样品等分为5份,并向每份中加入1种纳米磁珠并孵育(共5种)。每一种纳米磁珠依据其各自的理化特性,与样品中的蛋白质形成独特且可重现的蛋白冠(蛋白质包裹纳米磁珠,步骤1)。借助纳米磁珠的磁性,蛋白冠被吸附在磁铁上,通过洗涤步骤去除非特异性结合蛋白(步骤2)。
洗涤后,结合在纳米磁珠上的蛋白冠经过变性、酶解生成肽段(步骤3)。肽段经固相萃取并纯化。程序运行结束后,肽段经低温冻干后可直接进行质谱检测(步骤4)。由于纳米磁珠的选择性吸附,可极大压缩样品中蛋白质丰度的动态范围(Protein Abundance Dynamic Range),使更多的低丰度蛋白被“富集”,从而经质谱可鉴定、定量更多的蛋白质(LC-MS测试时间30-90min)。接下来,将质谱数据导入Proteograph QC软件进行搜库(Database Search)、统计和数据可视化分析(步骤5)。

简单直观ProteographTM分析软件
ProteographTM数据分析软件简洁易用,可最大限度地提高实验性能并发掘深度信息(图3)。该软件包括运行和数据分析质检工具,可快速有效地获得深度信息。
ProteographTM分析套件借鉴了当下主流的质谱数据分析软件(如MaxQuant),通过简洁统一的界面展示质检分析结果的综合视图。我们也提供相应的云服务,并新增了额外的功能模块可实现复杂的数据运算,如蛋白质基因组学和多组学联合数据分析。

